Cette instance a pour objectif d'assister le conseil d'administration et la directrice de l'établissement dans leurs décisions, en apportant des avis scientifiques sur les projets qui touchent au cœur du parc et sur les orientations stratégiques. L’objectif est de préserver les patrimoines naturel, culturel et paysager.
Le précédent conseil scientifique avait été créé le 19 mars 2007. Plusieurs centaines d’avis ont été émis sur différents dossiers : installations d’activités en cœur de parc, programmes et travaux d’aménagement, prélèvements d’espèces indigènes, etc. Le conseil scientifique a également apporté son expertise pour la constitution du dossier de candidature au Patrimoine mondial.
La composition du Conseil Scientifique:
Christian Barat : spécialité anthropologie
Pierre Bosc: spécialité hydrobiologie
Philippe Breuil : spécialité gestion d’espaces naturels