Près de six millions de personnes étaient toujours sous le coup d'avis d'évacuation, et les autorités ont appelé la population à rester en alerte, en particulier dans les zones où les rivières se déchaînaient encore après de longues heures de pluie.
Dans le département de Miyazaki, certains secteurs ont reçu plus de précipitations en 24 heures qu'ils n'en reçoivent normalement pendant tout le mois de septembre. "Nous vous demandons de rester vigilants face aux (risques) d'inondations et de glissements de terrain", a lancé à la population un responsable gouvernemental, Yoshiyuki Toyoguchi.
Les autorités du département de Miyazaki ont confirmé le décès d'un homme d'une soixantaine d'années de la ville de Miyakonojo, qui a été retrouvé sans signes de vie dans une voiture submergée sur des terres agricoles.
Et dans la région de Fukuoka (sud-ouest), les autorités ont déclaré qu'elles enquêtaient pour déterminer si un autre décès était lié à la tempête.
Le Premier ministre japonais Fumio Kishida, qui devait partir lundi pour l'Assemblée générale des Nations unies à New York, retardera son voyage d'un jour pour vérifier l'ampleur des dégâts, a confirmé son bureau.
Toutefois, compte tenu de l'intensité du typhon qui a touché la côte sud-ouest avec des rafales atteignant 234 km/h, les dégâts semblent relativement limités jusqu'ici.
"Le typhon a pratiquement disparu aujourd'hui (lundi) et la pluie et le vent se calment aussi maintenant", a déclaré un responsable de la gestion des crises dans la ville de Saito (département de Miyazaki).
"L'électricité est coupée dans certains endroits" et des habitants ont signalé "des arbres renversés", a-t-il dit, en mentionnant des inondations dans "certaines zones".
"Pas en sécurité chez moi"
Dans l'île de Kyushu, des milliers de personnes ont passé la nuit dans des abris, tandis que d'autres se sont installées dans des bâtiments plus solides.
Dans la ville d'Izumi (département de Kagoshima), Yasuta Yamaguchi, 30 ans, s'est réfugié dans un hôtel. "Je suis venu pour m'abriter car il y avait du vent et je pensais que c'était dangereux", a-t-il expliqué, "je ne me sentais pas en sécurité chez moi".
Lundi après-midi, plus de 240 000 foyers des régions de Kyushu et de Chugoku étaient encore privés d'électricité, ont indiqué les services publics, alors que la tempête remontait lentement le long de la côte ouest du Japon.
Des centaines de vols ont été annulés et les services ferroviaires dans les régions touchées ont également été interrompus au plus fort des intempéries.
Cyclones meurtriers
La saison des typhons culmine d'août à septembre au Japon, où elle est marquée par de fortes pluies susceptibles de provoquer de brusques inondations et des glissements de terrain meurtriers.
En 2019, le typhon Hagibis s'était abattu sur le Japon en pleine Coupe du monde de rugby, causant la mort de plus de 100 personnes.
Un an plus tôt, le typhon Jebi avait entraîné la fermeture de l'aéroport du Kansai à Osaka, tuant 14 personnes.
Et en 2018, des inondations et des glissements de terrain ont fait plus de 200 morts dans l'ouest du Japon pendant la saison des pluies.
Des scientifiques estiment que le changement climatique augmente l'intensité des tempêtes et les phénomènes météorologiques extrêmes.